現在の札幌別院は、明治政府から下賜された地に、東本願寺の管刹(寺)を建立したのが始まりで、後に明治9年札幌別院と改められました。それ以後、北海道に於ける教化伝道の拠点となって活動し今日に至っております。

長い歳月を経た今日、札幌市は高層ビルが建ち並び、180万の人口を擁する日本でも代表的な大都市に発展致しました。そのような時代の変遷、街並みの変貌を一世紀以上にわたり、静かに見つめてきた札幌別院は、唯一街の証人ともいえます。

境内に根をしっかり下ろした銀杏や柏の大樹、風雪に耐えに耐えてきた御堂等、いかにも先人のご苦労の歴史を物語ってくれています。鐘楼の梵鐘の音は、今日の我々に、語り部として静かに響きを伝えてくれます。